Футболен клуб "Мисолонги" е основан през 1926 г. в едноименния град в Гърция. Цветовете на отбора са зелено и бяло, а домакинските им мачове се играят на градския стадион "Мисолонги", който има капацитет от 2500 места. Отборът се състезава в трета дивизия от гръцкия футбол.

През своята история "Мисолонги" е спечелил няколко трофея. Те са трикратни шампиони на западната трета дивизия (1979, 1989, 2002) и два пъти са носители на Купата на западната трета дивизия (1980, 1995).

Отборът е познат и с участието си в Купата на Гърция. Най-големият успех на "Мисолонги" в турнира е достигането до осминафиналите през сезон 1999-2000, където отпадат от "Панатинайкос".

Известни футболисти, играли за "Мисолонги", включват Йоргос Карагунис, който е бивш капитан на гръцкия национален отбор, и Христос Пацацоглу, който е бивш вратар на "Олимпиакос".